1990年6月，中国举办了首届BNCT肿瘤学术研讨会。1999年，中国台湾省新竹清华大学开始从事细胞和小动物的BNCT基础研究。2010年至2013年，新竹清华大学和台北荣总医院研究团队对17名复发性头颈癌患者进行了BNCT临床试治。

　　截至2021年，中国台湾省已经完成了230多例头颈癌和脑瘤的人体临床研究。2010年初，周永茂院士团队在北京建造了世界上第一个用于BNCT的核反应堆中子源装置(IHNI-1)。2014年，中国首例BNCT临床试治黑色素瘤在IHNI-1上成功实施，填补了中国大陆BNCT研发的空白。在接下来的三年里，IHNI-1接受了三名黑色素瘤患者的7次临床照射。

　　中国发展和改革委员会发布的2017年第1号公告将硼中子捕获治疗系统及其靶向药物列入十三五国家战略性新兴产业发展规划。2019年，中国硼医疗与厦门弘爱医院联合建设了中国第一个加速器BNCT中心，该中心配备了国际领先的设计（两级治疗室和一个垂直治疗室）。是世界上最完善的配套设施和最大的单体BNCT综合诊疗中心。致力于建设国家BNCT技术示范基地。